Рособрнадзор выдает лицензию на обучение, но Минобрнауки не может издать приказ для учреждения не являющим его структурным подразделением. Институт аэронавигации находится в ведении единственного учредителя ФГУП «Госкорпорация по ОрВД». И только его приказы он должен выполнять, или совместные приказы двух ведомств.
Институт имеет Свидетельство (Сертификат) соответствия требованиям Воздушного законодательства Российской Федерации, выданный от 08.07.2013 г. № 185 Федеральным агентством воздушного транспорта Минтранса России, но при этом нарушает одно из требований воздушного законодательства РФ.
И не рекомендации Минобра выполнять, а законы и постановления правительства и приказы минобра, связанные с организацией любого учебного процесса, и которые должны, как минимум, выполняться учебными заведениями, т.к. лицензируются они Минобром.